Spekularna mikroskopija omogoča in vivo pregled endotelnih celic roženice. Endotel je tanek notranji sloj roženice,ki je bistven za vzdrževanje prozornosti roženice. Število endotelnih celic se lahko z leti zmanjšuje saj se celice ne obnavljajo in funkcijo odmrlih celic prevzemajo sosednje celice, ki zato postajajo vse večje, da pokrijejo celotno notranjo površino roženice. Večje kot so celice oz. manjše kot je njihovo število, večja je možnost, da zaradi okvare roženice vidimo megleno. S pomočjo spekularne mikroskopije ugotovimo število endotelnih celic na mm2, njihovo obliko, gostoto in velikost. S pomočjo kamer z visoko resolucijo in naprednih računalniških algoritmov popolnoma neboleče in hitro ugotavljamo več parametrov endotela roženice, polimegatizem, pleomorfizem, različnih statističnih indeksov, pahimetrija in histogram. Preiskava se opravi brez dotika s površino očesa in omogoča tudi spremljanje sprememb v določenem časovnem intervaluTa tehnika je nujo potrebna diagnostična preiskava za številne operativne in neoperativne postopke zdravljenja, ki jih izvajamo v Očesnem kirurškem centru dr. Pfeifer. Na osnovi rezultatov spekularne mikroskopije , lahko predvidevamo kakšen bo rezultat operacije na sprednjem segmentu očesa, lahko ugotovimo ali je potrebno že opraviti keratoplastiko oz. presaditev roženice in ugotovimo kakšen je rizik operacije sprednjega segmenta. Najpogostejše bolezni, ki jih lahko potrdimo s pomočjo spekularne mikroskopije so : cornaea gutatta, endotelna distrofija roženice, bulozna keratopatija in druge. Pred operacijo korekcije dioptrije z znotrajočesno lečo ob slabi roženici je spekularna mikroskopija nujna diagnostična preiskava.